?????? NGS ??? ??????????? ????????? ? ?????????? ???????????? ????????
Среди культивируемых ракообразных гигантская пресноводная креветка Macrobrachium rosenbergii до недавнего времени была одним из основных видов с высокой коммерческой ценностью. В последнее время он потерял популярность из-за болезней и дифференцированного роста самцов в силу социальной иерархии. Этот вид может вернуть свой прежний предпочтительный статус, если генетически улучшить его рост и устойчивость к болезням. Селекционная селекция значительно облегчается благодаря селекции с помощью маркеров (MAS). Однонуклеотидные полиморфизмы (SNPs) обеспечивают самое высокое разрешение, возможное для маркерной карты (изменение одного нуклеотида), являются ко-доминантными, би-аллельными и обычно многочисленными в популяциях с низким уровнем мутаций. Секвенирование ДНК с помощью платформ NGS считается наиболее экономически эффективным подходом. В данном исследовании поиск SNP проводился в транскрибированных последовательностях M. rosenbergii, доступных в GenBank, NCBI. Дикие экземпляры были собраны из различных водоемов. Были разработаны праймеры для амплификации кодирующих (CDS) и проведено секвенирование ампликонов на платформах GS-FLX 454 и Ion torrent. В разных популяциях было обнаружено 173 SNP. Такой подход для поиска SNP в представленных последовательностях был использован нами впервые.
1144587944
?????? NGS ??? ??????????? ????????? ? ?????????? ???????????? ????????
Среди культивируемых ракообразных гигантская пресноводная креветка Macrobrachium rosenbergii до недавнего времени была одним из основных видов с высокой коммерческой ценностью. В последнее время он потерял популярность из-за болезней и дифференцированного роста самцов в силу социальной иерархии. Этот вид может вернуть свой прежний предпочтительный статус, если генетически улучшить его рост и устойчивость к болезням. Селекционная селекция значительно облегчается благодаря селекции с помощью маркеров (MAS). Однонуклеотидные полиморфизмы (SNPs) обеспечивают самое высокое разрешение, возможное для маркерной карты (изменение одного нуклеотида), являются ко-доминантными, би-аллельными и обычно многочисленными в популяциях с низким уровнем мутаций. Секвенирование ДНК с помощью платформ NGS считается наиболее экономически эффективным подходом. В данном исследовании поиск SNP проводился в транскрибированных последовательностях M. rosenbergii, доступных в GenBank, NCBI. Дикие экземпляры были собраны из различных водоемов. Были разработаны праймеры для амплификации кодирующих (CDS) и проведено секвенирование ампликонов на платформах GS-FLX 454 и Ion torrent. В разных популяциях было обнаружено 173 SNP. Такой подход для поиска SNP в представленных последовательностях был использован нами впервые.
27.0
In Stock
5
1
?????? NGS ??? ??????????? ????????? ? ?????????? ???????????? ????????
96?????? NGS ??? ??????????? ????????? ? ?????????? ???????????? ????????
96Paperback
$27.00
27.0
In Stock
Product Details
ISBN-13: | 9786205086551 |
---|---|
Publisher: | Sciencia Scripts |
Publication date: | 08/18/2022 |
Pages: | 96 |
Product dimensions: | 6.00(w) x 9.00(h) x 0.23(d) |
Language: | Russian |
From the B&N Reads Blog